마술사 〈마스터〉와 영령 〈서번트〉가 모든 소원을 이루어주는 원망기 "성배"를 둘러싸고 싸운다 - "성배전쟁".

이전 일본에서 진행된 제5차 성배전쟁으로부터 몇 년이 지났다.

미국 서부 도시 스노우필드에서 새로운 성배의 전조가 관측되고 있다.

그리고 모여드는 마술사 〈마스터〉와 영령 〈서번트〉들 - 부족한 클래스.

선택되지 않을 것 같은 서번트.

음모를 꾸미는 국가.

전쟁을 위해 만들어진 도시.

- 수많은 이상한 일들로 인해 "성배전쟁"은 혼돈스러워지고 비틀어진다.