고대의 생명체가 존재한다는 정보를 입수한 구제적인 비밀 과학단체의 의뢰를 받은 탐사팀이 지도에도 없는 미지의 해골섬인 스컬 아일랜드를 찾아 나선다. 탐사팀의 등장으로 그 섬의 주인인 ‘콩’을 깨우게 되고, 설상가상 지하세계에 잠들어 있던 콩의 적들까지도 깨어나는데... 역대급 대결, 누구도 살아나갈 수 없다!